Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIK1P57059 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIK1P57059 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIK1P57059 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIK1P57059 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIK1P57059 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms