Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms