Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP12AP54707 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP12AP54707 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms