Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCR4P51679 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCR4P51679 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCR4P51679 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCR4P51679 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCR4P51679 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCR4P51679 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCR4P51679 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms