Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DAP3P51398 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DAP3P51398 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DAP3P51398 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms