Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CRIP1P50238 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms