Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPAP49450 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms