Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD97P48960 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD97P48960 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD97P48960 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD97P48960 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD97P48960 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD97P48960 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD97P48960 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CD97P48960 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD97P48960 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CD97P48960 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD97P48960 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD97P48960 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD97P48960 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD97P48960 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD97P48960 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD97P48960 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD97P48960 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CD97P48960 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CD97P48960 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD97P48960 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD97P48960 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD97P48960 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms