Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTDSS1P48651 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms