Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRIP1P48552 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRIP1P48552 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms