Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms