Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCAMP43121 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCAMP43121 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCAMP43121 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCAMP43121 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms