Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FDFT1P37268 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms