Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM23P36406 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms