Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GJC1P36383 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GJC1P36383 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms