Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPB2P35606 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPB2P35606 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms