Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SPRR1AP35321 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SPRR1AP35321 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms