Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNB1P35222 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms