Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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CASQ1P31415 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
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CASQ1P31415 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CASQ1P31415 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CASQ1P31415 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASQ1P31415 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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