Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA11P31270 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms