Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA10P31260 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXA10P31260 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms