Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMPK1P30085 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CMPK1P30085 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms