Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPHB2P29323 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms