Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRMP28827 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms