Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GCAP28676 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCAP28676 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCAP28676 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms