Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB4P28070 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms