Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNMT1P26358 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT1P26358 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms