Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN3P26045 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN3P26045 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms