Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGA3P26006 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms