Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APCP25054 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APCP25054 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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APCP25054 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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APCP25054 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APCP25054 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
APCP25054 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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