Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRDP23468 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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