Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CA6P23280 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CA6P23280 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CA6P23280 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CA6P23280 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms