Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB1P14653 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms