Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms