Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RLBP1P12271 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RLBP1P12271 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms