Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX6A1P12074 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms