Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC192P0DO97 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms