Protein–RNA interactions for Protein: P0CB47

UBTFL1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL1P0CB47 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFL1P0CB47 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFL1P0CB47 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms