Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPBP07199 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPBP07199 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPBP07199 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPBP07199 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms