Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CBX7O95931 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBX7O95931 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX7O95931 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms