Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP19O94966 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP19O94966 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP19O94966 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP19O94966 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP19O94966 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms