Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOX1O75936 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOX1O75936 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms