Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCATO75600 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCATO75600 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCATO75600 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCATO75600 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCATO75600 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCATO75600 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCATO75600 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCATO75600 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GCATO75600 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCATO75600 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCATO75600 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCATO75600 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms