Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms