Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF1O43189 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHF1O43189 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms