Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VGFO15240 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VGFO15240 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VGFO15240 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGFO15240 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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