Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APAF1O14727 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APAF1O14727 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APAF1O14727 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APAF1O14727 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms