Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCSO14618 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCSO14618 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCSO14618 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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