Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARID1AO14497 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms