Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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